非深圳牌照在深圳开车存在以下限制：

1. 限行政策：深圳市实行了机动车尾号限行措施，根据尾号不同，车辆在特定时间段内不能上路行驶。非深圳牌照的车辆也需要遵守此限行政策。

2. 违规处罚：若非深圳牌照的车辆在深圳违反交通法规，如超速、闯红灯等，将会接受罚款、扣分等处罚。处罚金额和扣分情况与深圳牌照车辆相同。

3. 限制部分道路：深圳市部分道路对非深圳牌照车辆进行了限制，如禁止进入特定区域、禁止通行的区域等。这些限制可能根据交通拥堵、环境保护等因素而设定。

4. 通行证要求：非深圳牌照车辆需要获得特定的通行证才能在深圳市内行驶，如临时通行证、工作通行证等。这些通行证的获得条件和使用期限可能根据不同情况而有所不同。

总的来说，非深圳牌照在深圳开车需要遵守深圳的交通规则和限制措施。如果违反规定，将会受到相应的处罚。因此，非深圳牌照的车主在深圳开车时需要了解相关规定，并主动遵守，以确保安全合法地行驶。