制造业创新能力在以下几个方面存在不足：

1. 技术创新能力不足：制造业创新主要依赖于技术的突破和创新，但许多制造企业在技术研发和创新方面投入不足，缺乏核心技术和自主知识产权，导致创新能力不强。

2. 人才创新能力不足：制造业创新需要高素质人才进行研发和实施，但许多制造企业人才队伍结构不合理，缺乏高层次的科研人员和创新型人才，限制了创新能力的提升。

3. 创新投入不足：制造业创新需要大量的投入，包括研发经费、设备购置和技术引进等，但许多制造企业在创新投入方面存在短板，缺乏长期稳定的资金支持，限制了创新能力的发展。

4. 制度创新能力不足：制造业创新需要有良好的创新环境和政策支持，但许多制造企业在制度创新方面存在不足，缺乏创新激励机制和知识产权保护制度，制约了创新能力的提升。

5. 制造业与其他行业融合不足：随着科技进步和产业升级，制造业需要与其他行业进行融合创新，但许多制造企业与其他行业的融合能力不足，缺乏跨界合作和创新的机会，限制了创新能力的发展。

综上所述，制造业创新能力的不足主要包括技术创新能力、人才创新能力、创新投入、制度创新能力和融合创新能力等方面的问题。解决这些问题需要加强技术研发和创新投入，培养高素质的创新型人才，改善创新环境和政策支持，促进制造业与其他行业的融合创新。