军工院所改制的原因主要包括提高效益、增强市场竞争力和促进科技创新等方面。随着市场经济的发展，军工院所的管理体制和运作模式已经不适应当今的经济环境。改制能够引入市场机制，激励企业内部的创新和竞争，提高效益和生产力。另外，改制也有利于引入外部资本和技术，提升企业的技术水平和竞争力。通过改制，军工院所可以更好地适应市场需求，实现可持续发展。